手游只有修改安装文件的方法吗

新人一个，以前只做过单机的电脑游戏修改，一般图省事都是替换修改过的文件方式达到目的。
刚刚接触手游的修改，看了不少教程都是，解包apk后修改再打包，
有个疑问，为何还没看到安装后再修改文件的，然道那样的方式达不到目的，更少了apk签名之类的烦恼不是吗。
讨论下，直接修改安装后的文件是否可行